一、办公室
    负责局机关日常工作的协调、会议的组织和对外联络、接待工作，掌握渔业动态，草拟局机关重要文稿；负责局机关文秘、档案、信息、信访、保密、提案办理、宣传报道、安全保卫等工作；布置检查直属单位治安工作，负责计划生育工作。

二、计划财务股
   负责水产项目的预审和申报；筹集、安排管理县级水产各项资金，管理局机关各项资金；编报水产行政经费和事业费预决算；负责直属单位的国有资产管理和固定资产投入的审批；负责全县水产行业财务管理的指导监督和国有水产企事业单位的财务管理和决算及年报工作；负责全县水产统计工作。

三、政工股
    贯彻执行上级有关人事、劳动方面的方针、政策、法规并组织实施；按照干部管理权限，负责干部考核、任免和呈报的具体工作；负责局机关及直属单位的党如、人事、机构编制、劳动工资工作和精神文明建设；管理水产成人教育工作。负责局机关离退休人员服务管理工作。

四、科技生产股
    制订全县渔业发展的中长期规划，年度指导计划和技术进步措施；组织科技攻关与协作和专业技术培训，负责科技成果、科研项目的申报、管理及成果推广与科技普及工作，负责全县水产科技推广体系建设和鱼病防治网络建设；负责全县水产名特优苗种基地建设的规划、布局、技术指导和水产种质资源库管理及引种、对外交换的审批管理，指导全县水产业结构和产品结构调整；归口管理渔船、渔机、渔具的制造和鱼药生产许可证申报与水生动植物检疫。负责指导、协调有关船检、港监、渔政管理工作。

五、市场加工企业股
    指导全县水产品冷茂与加工、渔用饲料加工；收集发布水产品市场信息，指导水产品流通；拟订水产品市场体系建设规划并组织实施；负责全县渔业对外经济技术交流与合作。负责直属国有企业有关管理及经营审计检查工作。

六、局属二级单位：

渔政管理局
杨柳湖渔场       大源湖渔场     城关渔场
水产贸易公司     大源湖水产开发公司
水产供销公司     渔需物资公司